За първи път учените а успели да разчетат генома на гинко билоба (Ginkgo biloba) - най-древният съществуващ и днес дървесен вид, съобщи ЕurekАlert!.
Резултатите са публикувани в списание GigaScience, а данните за секвенирането са на разположение в публичния регистър NCBI под регистрационен номер PRJNA307642.
Въпреки огромния интерес на учените към растението, декодирането на генома на гинко е трудна задача поради огромния му обем и гигантския брой повтарящи се последователности, които пречат на разчитането на генетичния код.
Изследователи са определили, че геномът на гинко се простира на повече от 10 GB, което е 80 пъти повече от генома на "моделното растение" Arabidopsis thaliana, геномът на гинко е приблизително 3,5 пъти повече от човешката ДНК и 76,5 % от него се състои от повтарящи се елементи и "боклучава ДНК" (ДНК, която няма видима функция).
Геномът на дървото е по-голям от този на други растителни видове, известни с изключително големите си геноми като царевица или орхидеи.
Големият интерес към растението заради историята и биологията му обаче правят работата по секвенирането и сглобяването на генома предизвикателство за изследователите от Китай, които смятат, че си заслужава усилията и в крайна сметка, успяват.
В хода на изследването генетиците са анализирали приблизително два терабайта данни. Значителна част от ДНК на растението, която е по-малко от една четвърт от общия геном, съдържа 41 840 гени, "шаблони", които клетките на дървото използват, за да направят най-сложните протеинови молекули, които изграждат и поддържат организма, обяснява ВВС news.
Много от гените са били изключително необичайно подредени. Например гинко билоба има аномално голям брой гени, които защитават растението от стрес, микроби и вредители.
Усилията на екипа си струват по най-различни причини. Едната със сигурност се отнася до статута му на "жива вкаменелост" - термин, използван за такива организми, които са имали много малка промяна в продължение на милиони години. Гинко билоба има екземпляри, консервирани в скали от преди 270 милиона години в периода Перм.
Като единственият оцелял представител на крайно необичайно група от нецъфтящи растения гинко запазва характеристиките си в продължение на милиони години като най-емблематични са ветрилообразните листа, които не се срещаат в нито един друг оцелял до днес растителен вид. Гинко билоба има уникална позиция в еволюционното дърво.
Професор Yunpeng Zhao, един от авторите, обяснява как тази еволюционна позиция е от голям интерес за изследователите: "Гинко представя една от петте съвременни групи семенни растения, коеъо все още няма живи роднини Този геном запълва една голяма филогенетична. празнина на земните растения и осигурява основни генетични ресурси за справяне с еволюционни въпроси като филогенетичните връзки на родословието на голосеменните, еволюцията на генома и гените в земните растения, появата на нови характеристики в развитието, еволюцията на пола, както и историята на демографията и разпространението, устойчивостта и запазването на гинко".
Изследователите са впечатлени също и от издръжливостта гинко на неблагоприятни условия - заслужава да се отбележи, че дърветата гинко са от малкото живи същества, оцелели при бомбардировките на Хирошима. Тази устойчивост вероятно е помогнала на гинко да оцелее през ледниковия период в Китай, убил много други видове, заради нея вероятно се дължи дълголетието на отделни дървета, някои от които живеят до няколко хиляди години. Гинко може да се защитава и срещу широк спектър от вредители, използвайки арсенал от химически оръжия срещу насекоми, бактерии и гъбички.
В момента диворастящи гинко билоба могат да бъдат намерени само на едно място в Източен Китай, където горички на тези дървета растат в природата.
Под формата на културни насаждения местните жители използват листата на Гинко като компонент на различни традиционни лекарства.
Коментари
Моля, регистрирайте се от TУК!
Ако вече имате регистрация, натиснете ТУК!
Няма коментари към тази новина !
Последни коментари